Antes de organizar um sistema de transporte neonatal, deve ser feito um planejamento e estabelecida a coordenação nos âmbitos nacional e regional para alinhar as metas e objetivos de transporte com os do sistema de saúde em seu conjunto.
O processo de planejamento inclui:
• Alinhamento dos objetivos que procuram melhorar os resultados no sistema de saúde e os casos prioritários (e casos excluídos) para o transporte.
• Estimativa da demanda de atendimento por cada problema de saúde selecionado e por região (necessidades satisfeitas e insatisfeitas).
• Instalação de centros de atendimento primário e referência para cobrir a demanda de atendimento (distribuição com base na população).
• Estimativa da demanda de transporte para alcançar um acesso equitativo ao atendimento (levando em conta a distribuição da população).
• Estabelecimento de redes de encaminhamento por cada problema de saúde selecionado e por região (segundo as subespecialidades disponíveis).
• Determinação do modelo administrativo e de governança do sistema de transporte (estatal ou privado, organização independente ou dependente do sistema hospitalar).
• Definição do plano operacional e do fluxo de renda econômica (em linha com os benefícios de cobertura de planos de seguro de saúde, com a responsabilidade financeira dos hospitais que encaminham os pacientes e dos hospitais que os recebem, disposições existentes para os pacientes sem plano de saúde ou com afecções não cobertas).